激光共聚焦显微镜在医疗领域主要有以下几个应用

　　激光共聚焦显微镜[Confocal Laser Scanning Microscope（CLSM或LSCM）]在反射光的光路上加上了一块半反半透镜（dichroic mirror），将已经通过透镜的反射光折向其它方向，在其焦点上有一个带有针孔（Pinhole）的挡板，小孔就位于焦点处，挡板后面是一个光电倍增管（photomultiplier tube，PMT）。可以想像，探测光焦点前后的反射光通过这一套共焦系统，必不能聚焦到小孔上，会被挡板挡住。于是光度计测量的就是焦点处的反射光强度。其意义是：通过移动透镜系统可以对一个半透明的物体进行三维扫描。

　　激光共聚焦显微镜是利用光学相干断层成像术，一种高分辨率、非接触性的生物组织成像技术，能使医生在活体上获得类似于眼组织病理改变的影像，是继眼科放射、超声、眼底血管造影诊断后又一全新的影像学诊断技术。是通过近红外弱相干光学射到待测组织，依据光的干涉性产生干涉，采用超外差探测技术，测量反射回来的光强，用于组织浅表层成像，光学相干层析成像系统主要由共焦显微镜和弱相干干涉仪组成，有一系列的轴向深度扫描建，立OCT图像，OCT是由低相干光源光纤迈克尔逊干涉仪和光电探测系统等构成

　　激光共聚焦显微镜可以对活体组织进行原位、无创及实时的微结的探测和成像。因此，在医疗领域主要有以下几个应用：

　　1.对管准过动脉、眼睛及神经系统的检查；

　　2.提高传统活检的检查准确率；

　　3.作为外部介入治疗的导向；

　　4.眼角膜移植手术中，用激光对眼角膜切合后，利用OCT技术进行移植。